Uma das principais mudanças do SEI para o SUPER refere-se à modernização do layout e à mudança nos ícones e no menu lateral.
O menu lateral foi ordenado alfabeticamente e agora apresenta um campo de busca para facilitar a localização de um menu específico.
Os ícones também foram modernizados, permanecendo na mesma ordem em que se encontravam anteriormente no SEI, de modo que não é difícil a adaptação à nova aparência. A seguir, são apresentadas as correspondências entre os ícones do SEI e do SUPER.
| Tela onde Aparece o Ícone | Ação do Ícone | Ícone SEI | Ícone SUPER |
| Controle de Processos | Enviar Processo |  |
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| Controle de Processos | Atualizar Andamento |  |
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| Controle de Processos | Atribuição de Processos |  |
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| Controle de Processos | Incluir em Bloco |  |
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| Controle de Processos | Sobrestar Processo |  |
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| Controle de Processos | Concluir Processo nesta Unidade |  |
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| Controle de Processos | Anotações |  |
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| Controle de Processos | Acompanhamento Especial | - |  |
| Controle de Processos | Incluir Documento |  |
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| Controle de Processos | Gerenciar Ponto de Controle |  |
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| Controle de Processos | Gerenciar Marcador |  |
- |
| Controle de Processos | Adicionar Marcador | - |  |
| Controle de Processos | Remover Marcador | - |  |
| Controle de Processos | Processos com Credencial de Acesso nesta Unidade |  |
- |
| Controle de Processos | Controle de Prazos | - |  |
| Processo | Incluir Documento |  |
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| Processo | Iniciar Processo Relacionado |  |
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| Processo | Consultar/Alterar Processo |  |
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| Processo | Acompanhamento Especial |  |
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| Processo | Ciência |  |
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| Processo | Enviar Processo | |
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| Processo | Atualizar Andamento | |
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| Processo | Atribuir Processo | |
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| Processo | Adicionar aos Favoritos | - |  |
| Processo | Duplicar Processo |  |
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| Processo | Enviar Correspondência Eletrônica |  |
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| Processo | Relacionamentos do Processo |  |
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| Processo | Incluir em Bloco | |
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| Processo | Gerenciar Disponibilizações de Acesso Externo |  |
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| Processo | Anotações | |
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| Processo | Sobrestar Processo | |
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| Processo | Anexar Processo |  |
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| Processo | Concluir Processo | |
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| Processo | Gerar Arquivo PDF do Processo |  |
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| Processo | Gerar Arquivo ZIP do Processo |  |
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| Processo | Comentários | - |  |
| Processo | Gerenciar Ponto de Controle | |
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| Processo | Gerenciar Marcador | |
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| Processo | Controle de Prazo | - | |
| Processo | Controle de Processos |  |
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| Processo | Pesquisar no Processo |  |
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| Documento | Incluir Documento | - | |
| Documento | Consultar/Alterar Documento | |
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| Documento | Acompanhamento Especial | |
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| Documento | Enviar Processo | |
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| Documento | Atualizar Andamento | |
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| Documento | Editar Conteúdo |  |
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| Documento | Assinar Documento |  |
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| Documento | Gerenciar Liberações para Assinatura Externa |  |
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| Documento | Incluir em Bloco de Assinatura | |
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| Documento | Cancelar Documento |  |
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| Documento | Adicionar aos Modelos Favoritos |  |
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| Documento | Versões do Documento |  |
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| Documento | Gerar Circular |  |
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| Documento | Imprimir Web |  |
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| Documento | Gerar Arquivo PDF do Documento | - |  |
| Documento | Comentários | - | |
| Documento | Excluir |  |
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| Documento | Concluir Processo | |
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